專家認為，天然魚油中含有DHA是神經系統細胞生長及維持的一種重要元素，魚油中含有的EPA成分雖然也具有調節血脂、軟化血管的作用，但是應當瞭解的是，魚類本身並不能合成DHA，而是因為吃了含有DHA的藻類在體內有所積累，因而純度並不高。
商家對魚油的健腦、提高智力等功效多為誇大甚至虛假宣傳。隨著環境汙染的日益加劇，魚油內容易殘留汞等重金屬汙染，對人體形成危害。
而另有專家指出，由於某些魚類含有汞，而汞汙染物的大量存在，會損害新生兒以及兒童正在發育的神經系統，嬰幼兒應慎吃魚油!
每天服用深海魚油不超過3克的情況下，對大多數人來說都是安全的。服用深海魚油劑量過高，會導致血液不易凝結，增加出血的風險。可能會出現的魚油的副作用有：噯氣，口臭，胃灼熱，噁心，稀便，皮疹和流鼻血。 隨餐服用深海魚油補充劑，往往可以減少這些副作用的產生。某些魚類，特別是鯊魚、鯖魚和養殖鮭魚，可能會受到汞和其他化學品的汙染。
專家提示：幼兒、兒童及青少年需要補充不飽和脂肪酸，但是不建議從魚油膠囊補充，而是從食物中正常補充，比如：通過使用含藻油DHA的食用油來補充DHA。
