1、肛瘻切除術:切開瘻管並將瘻骨壁全部切除至健康組織,創面不於縫合;若創面較大,可部分縫合,部分敞開,填入油紗布,使創而由底向外生長至癒合。適用於低位單純性肛瘻。
2、瘻管切開術:是將瘻管全部切開開放。靠肉芽組織生長使傷口癒合的方法。適用於低位肛瘻,因瘻管在外括約肌深部以下。切刀開後只損傷外括約肌皮下部和淺部,不會出現術後肛門失禁。
3、肛瘻切除掛線療法:是利用橡皮筋或有腐蝕作用的藥線的機械性壓迫作用,緩慢切開肛瘻的方法。適用於距肛門3~5cm內,有內外口低位或高位單純性肛瘻,或作為複雜性肛瘻切開、切除的輔助治療。