一、第一級治療 給孩子以撫慰，搖動孩子，減低環境噪音，用熱水袋捂嬰兒腹部;對家長給予支持和關心;可服用中藥或二甲基硅油。一些中藥具有解痙作用，服用中藥(洋甘菊、馬鞭草、甘草、茴香、香峰草及薄荷組成的粉末)7天后，腸痙攣改善，但夜醒次數未見減少。二甲基硅油是一種非吸收性藥物，通過改變氣泡表面張力，使氣泡融合或彌散，促進氣體排出，對人體無副作用。試圖用它來減少腸道氣體。但有關它的研究結果並不一致。用二甲基硅油與安慰劑做自身交叉對照研究，1/4-2 /3患兒症狀有改善，但與安慰劑相比，無明顯差異。其他減少腸道氣體的藥物如活性碳、α-半乳糖苷酶能吸附氣體或幫助消化高纖維素食物，減少發酵產氣，但目前對腸痙攣的療效尚不肯定。
二、第二級治療 即藥物治療。可用解痙藥(如西託溴銨)能阻斷平滑肌的毒蕈鹼型受體，還可直接作用於平滑肌，解除平滑肌痙攣。無效者可用鹽酸雙環胺，它作為一種抗膽鹼能藥物，具有阿托品樣的解痙作用，並有一定的中樞安定作用，在治療嬰兒腸痙攣方面有一定的療效。但近來有研究發現，6個月以下的嬰兒用此藥可發生呼吸暫停，使此藥的應用受到限制。至今尚無一種完全有效的藥物來治療腸痙攣。
三、第三級治療 改變飲食和/或藥物治療。母乳餵養的母親不食用牛奶、奶製品、魚和蛋;人工餵養兒給予豆奶或水解酪蛋白的奶方，能明顯改善嬰兒腸痙攣。對於CMPI引起的腸痙攣者，去除牛奶蛋白，改用豆奶或水解蛋白後，71%-88%的患兒症狀有改善。由於藥物治療(如鹽酸雙環胺)有一定的副作用，而且有時療效不理想，飲食改變可能比用藥更適宜。
