女性支原體感染的治療方法要根據該病的特徵以及病因來選擇適合自己的方法，支原體、衣原體感染人體後，首先侵入柱狀上皮細胞並在細胞內生長繁殖，然後進入單核巨噬細胞系統的細胞內增殖。當人體感染支原體、衣原體後，產生特異性的免疫，但是這種免疫力較弱，持續時間短暫，因此，支原體、衣原體感染容易造成持續，反覆感染，以及隱性感染。
婦女感染支原體、衣原體後，不一定會出現症狀，即使有症狀，也因感染部位的不同而有所不同，例如子宮頸感染後可出現宮頸糜爛、宮頸黏膜水腫、白帶增多(呈膿性)、接觸性出血等女性支原體感染治療很重要，如果不及時進行治療，支原體感染常見的合併症為輸卵管炎，少數患者可出現子宮內膜炎及盆腔炎。這樣容易造成不孕症的發生，專家提醒成人主要通過性接觸傳播，新生兒則由母親生殖道分娩時感染。成人男性的感染部位在尿道粘膜，女性感染部位在宮頸。新生兒主要引起結膜炎和肺炎。
在選擇女性支原體感染的治療方法之前，患者還應注意一些事項，這樣才能保障得到很好的效果，女性支原體感染不限於尿道，可累及整個泌尿生殖器官，此類感染常因缺乏自覺症狀或症狀輕微而忽視了治療，導致傳染源繼續擴散，形成危害。無症狀女性支原體感染(缺乏症狀反應)：由於本病缺乏自覺症狀，則局部症狀便成為診斷的一個重要指標，表現為陰道有膿樣分泌物，亦可為粘液或漿液性。
