提到淋病，很多人是談虎色變，作為常見的性傳播疾病來說，淋病的危害主要體現在生殖器官上。尤其是女性，淋病的危害不但影響了女性的生理健康，還能通過傳染給下一代進一步影響了孩子的健康。
如果女性患者子宮頸受到淋球菌侵犯，可併發內生殖系統的感染，發生嚴重淋病，如盆腔炎、子宮內膜炎、急性輸卵管炎、卵巢膿腫，甚至一部分患者可發生盆腔膿腫、腹膜炎等，是淋病的危害主要內容。
發生上述合併症，均可出現不同程度的全身症狀，如寒戰、發熱、噁心、嘔吐、食慾不振、下腹痛、腰痛等。其中，急性輸卵管炎如果治療不及時或治療不徹底，可轉為慢性輸卵管炎，會引起宮外孕;由於輸卵管閉塞、粘連，淋病的危害還可體現在導致女性不孕上。
孕婦患上淋病的危害對本人及胎兒都是有影響的，孕婦易造成胎膜早破、羊膜腔感染以及流產、早產，甚至產後會引起敗血症。胎兒通過產道時，容易受母體子宮頸淋球菌的感染，發生新生兒淋球菌眼結膜炎和角膜炎，嚴重者可造成失明。
