輕症急性胰腺炎極少有併發症發生,而重症急性胰腺炎則常出現多種併發症。胰腺膿腫, 胰腺假性囊腫,臟器功能衰竭,病情中可繼發腹腔、呼吸道、泌尿道等感染。感染擴散可引起敗血症。後期因機體抵抗力極低,加上大量使用抗生素,易發生真菌感染。少數可演變為慢性胰腺炎。
慢性胰腺炎主要表現為慢性腹痛及胰腺內、外分泌功能不全,它與胰腺癌的發生有關。還可引發其他一系列併發症,最常見的併發症是假性囊腫的形成及十二指腸、共同通道的機械性梗阻,較少見的併發症有脾靜脈血栓形成並門脈高壓、假性動脈瘤的形成(尤其是脾動脈)及胰源性胸、腹水。