食管癌的人群分佈與年齡、性別、職業、種族、地域、生活環境、飲食生活習慣、遺傳易感性等有一定關係。經已有調查資料顯示食管癌可能是多種因素所致的疾病。已提出的病因如下：
1.化學病因
亞硝胺。這類化合物及其前體分佈很廣，可在體內、外形成，致癌性強。在高發區的膳食、飲水、酸菜、甚至病人的唾液中，測亞硝酸鹽含量均遠較低發區為高。
2.生物性病因
真菌。在某些高發區的糧食中、食管癌病人的上消化道中或切除的食管癌標本上，均能分離出多種真菌，其中某些真菌有致癌作用。有些真菌能促使亞硝胺及其前體的形成，更促進癌腫的發生。
3.缺乏某些微量元素
鉬、鐵、鋅、氟、硒等在糧食、蔬菜、飲水中含量偏低。
4.缺乏維生素
缺乏維生素A、維生素B2、維生素C以及動物蛋白、新鮮蔬菜、水果攝入不足，是食管癌高發區的一個共同特點。
5.煙、酒、熱食、熱飲、口腔不潔等因素
長期飲烈性酒、嗜好吸菸，食物過硬、過熱、進食過快，引起慢性刺激、炎症、創傷或口腔不潔、齲齒等均可能與食管癌的發生有關。
6.食管癌遺傳易感因素。
