1、免疫功能
可表現為自身免疫反應亢進，也可能表現為免疫功能的缺陷，後者多見。某些細菌、病毒等微生物的感染，可能是導致複發性口腔潰瘍的重要原因之一。任何會引起免疫功能紊亂的因素，都可能誘發口腔潰瘍。
2、精神因素
口腔患者許多是在過度精神疲勞後發病的，事實上，精神緊張、睡眠不足、工作壓力大、過度疲勞、精神不佳等，都可以導致到人體內環境失衡，也會激活在體內的病毒，從而導致潰瘍更多地發生。
3、內分泌
臨床上常常看到女性在月經期間易出現口腔潰瘍，常伴有口乾、心煩、易怒和大便乾結等令人煩惱的症狀。臨床研究發現，月經期出現口腔潰瘍主要是由於體內黃體酮水平增高而雌激素(孕酮等)的水平降低所致。
4、營養元素
維生素及微量元素缺乏也可導致口腔潰瘍，研究發現，缺葉酸、缺乏微量元素鋅、鐵、維生素B12等，可降低免疫功能，某種會導致潰瘍的病毒潛伏在口腔粘膜中，粘膜卻因為局部營養缺乏導致對其失去抵抗力，潰瘍由此產生。
5、消化系統疾病
患系統性疾病的患者易發生口腔潰瘍，主要是通過影響免疫系統而致口腔潰瘍。口腔潰瘍與胃潰瘍、十二指腸潰瘍、潰瘍性結腸炎、侷限性腸炎、肝炎等有關。慢性胃炎、胃十二指腸潰瘍、便秘等胃腸道疾病患者，複發性口腔潰瘍的發病率會明顯增高。因為，人體全身黏膜結構是相似的，慢性胃炎、胃十二指腸潰瘍等疾病的主要病損在消化道黏膜，它影響人體對維生素的吸收。不愛吃蔬菜水果的偏食者也易得口腔潰瘍。
6、慢性病
糖尿病、血液病、結核病等慢性病患者。由於黏膜的營養供應不良，也容易出現口腔潰瘍。
7、食物不耐受
如果口腔潰瘍反覆發作，持續數年甚至十幾年未愈，非常有可能與食物不耐受有關。食物不耐受指的是一種複雜的變態反應性疾病，人的免疫系統把進入人體內的某種或多種食物當成有害物質，從而針對這些物質產生過度的保護性免疫反應，產生食物特異性IgG抗體，引起所有組織發生炎症反應。
