色素斑的治療方式首先要確切弄清診斷，或具有擴大切除的處理能力，條件與施術者，其方法主要有非手術法和手術方法兩大類。冷凍療法治療色素斑：以液氮法冷凍應用最多。電灼或電乾燥法治療色素斑。治療色素斑的手術療法：主要通過外科手術，部分、大部或全部徹底切除病變組織。小痣可以切除直接縫合者則直接縫合，不能直接縫合時，屬良性痣則在痣中央分次切除法處治，完全、徹底切除，據病變痣的部位與大小，切除後以局部皮瓣，轉移皮瓣或植皮法覆蓋處理創面。
咖啡斑為淡褐色斑，棕褐色至暗褐色，大小不一，圓形、卵圓形或形狀不規則，邊界清楚，表面光滑。可在出生時或出生稍後出現，並在整個兒童時期中數目增加。多見於軀幹部，不會自行消退。激光治療咖啡斑沒副作用，不留疤痕，激光祛咖啡斑療部位保持清潔，避免感染和磨擦。痂皮脫落後，局部可有短暫色素沉著，為防止或減少此情況，可合理應用防曬祛斑用品。
咖啡斑多部位、多面積發病，(累積三個部位以上)需要注意是神經纖維瘤的預兆，此類咖啡斑有很高的遺傳性。可以採用C3激光、532，成功率50%，容易復發，3次以後沒有效果，基本就不建議治療。原則是顏色深好，顏色淺不好。後期輔助治療同樣可以防曬保溼，美白針，修復肽等促進恢復。激光治療咖啡斑通過局部麻醉，在數分鐘至數十分鐘就可以完成一次治療，激光治療咖啡斑操作十分方便，在過程中，只要患者和醫生需要保護眼睛。
