“大三陽”代表體內有乙肝病毒複製，具有傳染性。臨床上有不少“大三陽”者無症狀、肝功能正常，一般稱之為慢性“HBsAg攜帶者”(但事實上，其中有相當一部分人病理上有輕重不等的肝臟損害)，而對那些有症狀和肝功能異常者，稱之為慢性乙型肝炎病人。那麼，有了“大三陽”該怎麼辦呢?原則上說，“大三陽”者慶進行保肝、抗病毒和抗肝纖維化治療。保肝和抗肝纖維化治療適合於所有“大一陽”病人，但所有“大三陽”病人是不是都要進行抗病毒治療呢?答案是否定的。只有那些轉氨酶高(高於2倍正常值)的病人才有可能取得良好的療效。因此，對那些肝功能正常或基本正常的“大三陽”，特別是通過垂直傳播獲得感染者，我們並不主張進行抗病毒治療。
“目前，對‘大三陽‘病人的抗病毒藥物主要有干擾素、核苷類藥物如拉米夫定等，中藥如苦參素等，免疫調節劑α胸腺肽也常被用於抗病毒治療。干擾素因為其有較為肯定的抗病毒療效，而且可以抗肝纖維化和降低肝癌的發生率，因此對‘大三陽’病人一般首選干擾素治療。
當然，干擾素也存在著一定的不足，如使用後會引起一些副作用如發熱、白細胞減少等，而且單一用藥療效不盡如人意，普通干擾素的 HBeAg的血清轉換率(俗稱“大三陽”轉為“小三陽)不到40%。好在現在又上市了一種新的干擾素——聚乙二醇干擾(α-2a)，療效優於普通干擾素，使用起來較普通干擾素方便，只要一週一次。抗病毒治療的療程一般最短要半年，可以根據治療的結果在專業醫生的指導下決定治療方案和療程。
還需要說明的是，不是所有轉氨酶高的病人都能取得滿意的抗病毒效果。這一方面是目前所有藥物本身的抗病毒療效不是令人滿意，另一方面，臨床上引導起轉氨酶高的非肝炎因素很多，如勞累、休息不好、酒精、藥物等。有其他肝膽疾病如脂肪肝、膽囊炎、膽石症等。其他系統的疾病如心血管疾病、腎臟疾病等，這些因素容易被誤認為肝炎活動所引起，而導致抗病毒療效差。因此，在抗病毒治療前一定要注意鑑別。
