1.泌尿生殖道感染
潛伏期為1～3周，典型的急性期症狀與其他非淋病性生殖泌尿系統感染相似，表現為尿道刺痛，不同程度的尿急及尿頻，排尿刺痛，特別是當尿液較為濃縮的時候明顯，尿道口輕度紅腫，分泌物稀薄，量少，為漿液性或膿性，多需用力擠壓尿道才見分泌物溢出，常於晨起尿道口有少量黏液性分泌物或僅有痂膜封口，或見汙穢褲襠，亞急性期常合併前列腺感染，患者常出現會陰部脹痛，腰痠，雙股內側不適感或在做提肛動作時有自會陰向股內側發散的刺痛感。
女性患者多見以子宮頸為中心擴散的生殖系炎症，多數無明顯自覺症狀，少數重症病人有陰道墜感，當感染擴及尿道時，尿頻，尿急是引起病人注意的主要症狀，感染侷限在子宮頸，表現為白帶增多，混濁，子宮頸水腫，充血或表面糜爛，感染擴及尿道表現為尿道口潮紅，充血，擠壓尿道可有少量分泌物外溢，但很少有壓痛出現。
即使懷孕也很容易導致胚胎夭折、胎兒死亡、自然流產、低體重兒等。女性感染人型支原體，還可以引起腎盂腎炎、盆腔炎流產後發熱，產後發熱、非淋球菌尿道炎等疾病。
2.呼吸道感染
起病緩慢，潛伏期2～3周，病初有全身不適，乏力、頭痛。2～3天后出現發熱體溫常達39℃左右，可持續1～3周，可伴有咽痛和肌肉痠痛。
咳嗽為本病突出的症狀，一般於病後2～3天開始，初為乾咳，後轉為頑固性劇咳、常有黏稠痰液偶帶血絲，少數病例可類似百日咳樣陣咳。可持續1～4周。肺部體徵多不明顯，甚至全無。少數可聽到幹、溼囉音樂。但多塊消失，故體徵與劇咳及發熱等臨床表現不一致，為本病特點之一。嬰幼兒起病急，病程長，病情較重，表現為呼吸困難、喘憋、喘鳴音較為突出，肺部囉音比年長兒多。部分患兒童可患有溶血性貧血，腦膜炎、心肌炎、格林-把利綜合徵等肺外表現。
