甲型、戊型肝炎按消化道疾病的隔離措施，如加強水源管理、保護水源、提高環境衛生水平、加強食品衛生監督、注意食品衛生，養成良好的衛生習慣等，目前還有甲肝疫苗可用於預防甲肝(詳見本網站的甲型病毒性肝炎相關部分);
乙型肝炎及丙型肝炎按血液傳播性疾病來預防，如嚴格篩選獻血員、推行安全注射、醫務人員接觸患者血液及體液時應戴手套、對靜脈吸毒者進行心理諮詢和安全教育，勸其戒毒、。不共用剃鬚刀及牙具等，理髮用具、穿刺和紋身等用具應嚴格消毒及性接觸時使用安全套。
此外目前已有乙肝疫苗，可預防乙肝個體間的傳染(包括阻斷母嬰傳播)，但丙型肝炎目前尚無有效的疫苗問世。乙型肝炎疫苗全程需接種3針，按照0、1、6個月程序，即接種第1針疫苗後，間隔1個月及6個月注射第2及第3針疫苗。對於阻斷母嬰傳播時還需於嬰兒出生後24 h內儘早(最好在出生後12 h)在不同部位注射乙型肝炎免疫球蛋白 (HBIG)，劑量應≥100 IU。
