1.甲減 許多地甲腫患者臨床甲功多正常(代償)，但應用放免技術測定激素以來，證實多數甲腫患者，甚至非甲腫患者都有程度不同的甲減改變。
2.甲亢 地甲腫病人中甲亢的發病率並不高，僅見於40歲以上的有毒性結節性甲腫的患者。這種甲亢與一般甲亢的症狀相同，放射性核素掃描可以發現濃集碘的熱結節，症狀一般比Graves病輕，易治癒，手術後不易復發。
3. 甲狀腺癌 甲狀腺癌是否與地甲腫有關，一直有爭論。值得高度重視的是，結節性甲狀腺腫癌變的可能性要大，特別是單個結節。從全世界的報道看，缺碘地區的濾泡癌和未分化癌(anaplastic)發病率高，而乳頭狀癌的發病率低;然而補碘後，在碘充足或高碘地區，濾泡癌和未分化癌發病率低，但乳頭狀癌的發病率高。
4. 氣管軟化 這是腫大的甲狀腺長期壓迫氣管的結果，質地堅硬或鈣化的甲狀腺結節直接壓迫氣管是造成軟化的主要因素。病人的主要症狀是呼吸困難(71.6%)，甚至不能平臥(16.4%)，半數以上患者還有心慌、氣促等心血管系統症狀。馬宵在陝西省對1.15萬地甲腫手術治療時，統計了甲狀腺的併發症。
地方性甲狀腺腫的另一個併發症為濾泡細胞性退行性癌及其肉瘤，用碘補充治療後，其發生率下降，且病程向良性化增加。
