首先，傳播方式是乙肝和丙肝的區別裡最明顯的一點，乙肝主要是通過母嬰傳播，丙肝主要是通過醫源性傳播。對於乙肝而言，有可以預防的疫苗，而丙肝卻沒有疫苗，這是也乙肝和丙肝的區別之一。
其次，丙型肝炎和乙肝的區別還有就是丙肝病毒比乙肝病毒更易發生變異。乙肝病毒是DNA病毒，而丙肝病毒屬於RNA病毒，極易發生變異，這也給治療和疫苗的研製增加了不少困難。
再次，病毒損害肝細胞的手段比乙肝病毒更多。乙肝病毒只會寄生在肝細胞內，它本身並不引起肝損傷，只有在身體的免疫系統受到病毒刺激而“生氣”的時候，才會和肝細胞中的乙肝病毒“打仗”，引起肝細胞“死亡”。所以，乙肝病毒感染者中肝功能正常的病毒攜帶者很常見。而丙肝病毒可以通過許多辦法導致肝細胞損傷。丙肝病毒可以直接破壞肝細胞.
最後一點乙肝和丙肝的區別是丙肝較乙肝容易治療。乙肝治療過程較長，需要定期檢查和長期調養，而丙肝不同，只要治療得當，可以很快康復。
