一、藥物治療：對於較小較少的損害。(1)5%5-Fu軟膏5-Fu是一種常用的抗腫瘤藥物，它能抑制細胞的增殖，力量較為溫和，一般需治療2～3周。(2)醋酸：三氯醋酸是一種強酸，可用來燒灼疣體，一般用於治療Ⅱ型病變。塗抹前先用棉球醮2%的卡因貼敷於病變局部3￣5分鐘後，用棉籤醮50%三氯醋酸塗抹病變，使藥液達基底部;塗藥時注意勿傷及周圍粘膜組織，經期勿用;每週用藥2次。或用20%柳酸冰醋酸外搽。
二、微波治療：這是進入90年代後興起的治療方法。它的原理是利用微波的高頻震動，使疣體內部水分蒸發，壞死脫落。微波治療的特點是，疣體破壞徹底，不易復發，但創面恢復較慢，容易繼發感染。所以微波治療特別適用於治療疣體較大的，孤立、散在的，同時要遠離繫帶的，以防損傷包皮繫帶，影響男性的性功能。
三、冷凍治療：液氮或二氧化碳乾冰冷凍，使疣組織(即皮膚損害局部)壞死。尖銳溼疣是由於尖銳溼疣病毒的感染，導致皮膚粘膜的良性增生。它有大量的小血管，增殖迅速。用冷凍的方法可使尖銳溼疣內結冰，形成組織局部的高度水腫，從而破壞疣體。冷凍治療的最大好處是局部不留痕跡，治癒率約70%左右。治療過程中除局部紅腫，疼痛及水皰反應外，一般無明顯後遺症。可用噴霧法或直接接觸法，適用於平坦較小的疣體。一般每週冷凍1次，連續2～3次。一般後治療。
四、激光治療：對外陰、肛門周圍等表淺的溼疣合適;它的特點是見效快，在治療的當時，疣體即可脫落。常用的是二氧化碳激光，燒灼疣體，一般1次即可使疣體脫落。但是，由於激光的光束過於集中的原故，激光治療只適用於疣體較小的尖銳溼疣，如疣體較大，激光治療很容易復發。治癒率可達80%。
五、電灼治療：電燒灼是較老的一種治療方法。過去皮膚科醫師常用高頻電刀或電烙鐵燒灼尋常疣、色素痣及其他皮膚贅生物。它的特點是操作簡單，見效快。高頻電刀能直接切除和乾燥疣體，治療也較徹底，但是，電燒灼瘡面癒合較緩慢。綜上所述，電燒灼治療，可用於任何尖銳溼疣的治療，但是對施術者的技術要求較高，燒灼太過或不足都是有害的。同時要注意無菌操作，預防感染。高頻電刀或電針，對宮頸或陰道較小病損治療較合適。較大的疣則需分批電灼。
六、手術切除：對帶蒂的較大、孤立的疣體可考慮手術切除。尖銳溼疣一般不主張手術切除，因為手術治療後，尖銳溼疣很容易復發，使治療失敗。但對帶蒂的較大的疣體或疑有惡變者，可考慮手術切除。有的患者尖銳溼疣生長過於迅速，或大如菜花，其他治療十分困難，可考慮手術治療。為防止復發，術後配合其他治療。根據疣塊、覆蓋面積，選擇病灶切除或外陰切除。
