1.咽喉部的炎症造成咳嗽、喘憋等，進而導致出現的呼吸道疾病很多。
2.咽喉部腫脹會影響食物的吞嚥。咽喉部的炎症或其它病變刺激食管支配神經，引起膈肌痙攣，會出現呃逆、心下痞等症狀。
3.頸項咽喉周圍有甲狀腺和甲狀旁腺、頜下腺、腮腺等內分泌器官，當頸項咽喉部炎症或其它病變時，容易通過淋巴管的分支擴散到這些內分泌器官，引起相應的內分泌器官病變，使內分泌失調，出現相應疾病。例如上呼吸道感染可併發腮腺炎、甲狀腺炎等。
4.咽喉部的炎症可以啟動全身的免疫系統，對侵入的細菌病毒進行攻擊，對正常組織進行保護。但是因為咽喉部刺激因素的強弱久暫不一，這些免疫反應有時不足，有時過強。不足就是免疫力低下、過強就是免疫力增強，不管是不足還是過強都會出現全身性疾病。例如腎小球腎炎就是對於咽部鏈球菌免疫力增強的結果。
5.頭顱與軀體是依靠頸項的頸椎、肌肉來連接支撐的，頭顱的轉動是最頻繁、最靈活的複雜關節，咽後壁的炎症可以導致頸椎椎體不穩，出現頸椎病。而頸椎病可能是引起高血壓、低血壓及血壓波動的重要原因。咽後壁的炎症可以蔓延到頸椎部位的軟組織，使頸部交感神經節受到刺激，使支配心臟、椎動脈的神經功能失調，出現心慌、頭暈、失眠等等症狀。
6.破裂孔導靜脈將顱外翼肌靜脈和咽靜脈與顱內海綿竇相交通，顱內海綿竇是相當重要的組織，當咽喉部慢性炎症侵入海綿竇時會引起海綿竇血栓，出現眼球固定、複視、頭痛等症。
