1.積極治療支原體感染。預防任何一種疾病都要找到源頭，預防支原體感染還需要對患者進行全面的治療，尤其性/伴侶患者的治療。對於支原體患者，在西醫抗生素久治不愈時，不妨試試中藥的治療，這裡男性患者可以選用中藥利尿消炎丸，女性患者可以選擇中藥婦炎丸，做到夫妻間的同時治療。
2.全面消毒。這是對於曾經感染過支原體的患者來說的。支原體並不可怕，它對熱抵抗力差，通常55℃經15分鐘處理可使之滅活。常規的消毒液都能殺滅。所以要求感染過支原體的患者及時對自己的衣物和洗具進行消毒。對於一些日常用品，一定不能共用，以免造成病原體大範圍傳播。
3.增強抵抗力，不濫用抗生素。過量使用抗生素而常常使機體菌群失衡。醫學上所說的“菌群平衡”是指人體內生活著一些微生物，包括衣原體和支原體，彼此之間達到一種平衡，使得相互的數量受到控制，不至於對人體造成影響。如果濫用抗生素，破壞了原有的“菌群平衡”，反而會出現讓某些微生物的數量劇增，支原體尿路感染髮生。
4.加強營養。這也是增強自身抵抗力的前提，只有營養充足，身體才會健康。多吃蔬菜水果，補充蛋白質，均衡飲食。
