1、性生活過頻：過頻的性生活，常會引起輸精管、精囊及尿道部位產生無菌性炎症，致使這些部位充血水腫。射精時，由於平滑肌收縮，而刺激這些充血的部位，引起射精疼痛。
2、結石：男性尿道結石是導致射精疼痛的常見疾病，當小的結石嵌在後尿道，尤其嵌在射精管的開品部位，射精時這些部位收縮和蠕動，擠壓結石而產生疼痛。如前列腺或精囊有結石，射精時這些部位收縮而產生疼痛。
3、生殖部位炎症：男性下尿路感染是導致射精疼痛最常見的原因。患有膀胱炎、尿道炎、，射精時，這些部位的肌肉發生節律性收縮，對炎症病灶是一種機械刺激，以致引起劇烈疼痛。有的患者還會發生疼痛性遺精。
4、腫瘤：男性泌尿生殖部位的惡性腫瘤，大多會引起射精疼痛。如睪丸、附睪、前列腺等處發生腫瘤時，壓迫或阻塞射精管道，射精時會發生疼痛。不過，其疼痛性質較為緩和，多是隱痛和痠痛。精囊，輸精管等處發生腫瘤的機會雖然不多，但病變的進展多為隱匿性。因此，這種疼痛應引起重視。
