1、呼吸道和肺部感染
變異性哮喘多數是因為呼吸道病菌感染而引發的。因此呼吸道系統的免疫功能受到阻礙，從而極易引發呼吸道和肺部病毒感染。一旦出現感染症狀，可依據病菌和藥敏選擇適當抗生素進行合理治療。
2、猝死
猝死是咳嗽變異性哮喘最嚴重的急性併發症，猝死常常無明顯先前症兆，一旦突發往往來不及搶救而導致死亡。
3、氣胸和縱隔氣腫
由於咳嗽變異性哮喘急性發作時氣體會滯留於肺泡內，讓肺泡含有大量氣體，肺泡內壓升高，變異性哮喘引發的肺氣腫會導致肺泡破裂，形成自發性氣胸。肺泡破裂會導致氣體進入皮下組織從而引起縱膈氣腫，會有生命危險。
4、水電解質和酸鹼失衡
由於咳嗽變異性哮喘急性發作時缺氧、攝食不足、脫水等，影響心、肝、腎和呼吸功能，常常併發水電解質和酸鹼失調。這些都是影響治療和反覆發作的重要因素。
5、多臟器功能不全和多臟器衰竭
咳嗽變異性哮喘急性發作是由於嚴重缺氧、感染、酸鹼失調、呼吸道出血和藥物的毒副作用，從而併發多臟器功能不全甚至功能衰竭。
6、呼吸衰竭
變異性哮喘急性發作時由於呼吸不暢、感染、治療和用藥不當、併發氣胸、肺部脹痛和肺水腫等，都是併發呼吸衰竭的常見誘因。呼吸衰竭，由於缺氧、二氧化碳瀦留和酸中毒，讓咳嗽變異性哮喘的治療就更加困難。
