病因尚不明瞭。神經精神因素被認為是一個重要因素。不少病例發病前有神經精神創傷如長期焦急、憂慮、悲傷、精神緊張和情緒不安等現象。有時在病程中，這些精神因素可使病情迅速加重。近年來研究，斑禿的原因與下列因素有關：
1、遺傳過敏：約10%～20%的病例有家族史。有報告單卵雙生者同時在同一部位發生斑禿，還有報告一家4代均有斑禿，認為是遺傳缺陷性疾病。從臨床累積的病便看出，具有遺傳過敏性體質的人易伴發斑禿。美國統計患斑禿的兒童患者中18%有溼疹或哮喘，或者兩者兼有;成人斑禿患者約佔9%;全禿的兒童患者比便更高，佔23%。日本統計的斑禿患者有遺傳過敏體質者佔10%，荷蘭則高達52.4%。不過荷蘭確立遺傳過敏體質的依據，是把陽性皮膚試驗和遺傳過敏家族史者也包括進行了。因此各國家及地區對遺傳過敏體質的診斷標準不同，數據也無法進行比較。國內陳盛強做的一項斑禿與人白細胞抗原的相關研究表明：斑禿病人的HLA-A9抗原頻率(16.67%)較正常人(32.65%)顯著降低，從實驗的角度支持斑禿的遺傳過敏因素。
2、自身免疫：班禿患者伴有一些自身免疫性疾病的比率比正常人群高。如伴甲狀腺疾病者佔0～8%;伴白癜風者佔4%(正常人僅1%)。而斑禿病人中有關自身抗體的研究報告不一，有說存在的，也有說未找到的。國內張信江的一項關於T細胞亞群及β2微球蛋白的研究中提示斑禿患者存在著T細胞網絡紊亂及體液免疫失調。
3、Down綜合徵：Down綜合徵中斑禿髮生率增高，常為全禿或普禿。這些病人中自身抗體的存在了明顯增多。
