1.急性腹瀉
(1)感染性：包括病毒、細菌、原蟲及寄生蟲、真菌等，尤以細菌性痢疾、致病性大腸桿菌、輪狀病毒、腸病毒、血吸蟲、沙門菌、變形桿菌等常見。
(2)中毒性：主要有動物、化學、植物等中毒，如毒菌、河豚、魚膽、重金屬、有機磷等。
(3)其他：如藥物利血平、洋地黃製劑、鉍劑、普萘洛爾、甲狀腺製劑等。內分泌代謝疾病如甲狀腺危象、腎上腺皮質功能減退症、糖尿病。變態反應性胃腸病也是常見的病因。
2.慢性腹瀉
(1)消化系統疾病：
1)腸源性慢性腹瀉：慢性細菌性痢疾、潰瘍型腸結核、腸道菌群失調、慢性阿米巴痢疾、腸鞭毛蟲病、胃腸型黑熱病、慢性血吸蟲病、腸道蠕蟲病、克羅恩病、潰瘍性結腸炎、嗜酸性粒細胞性胃腸炎、放射性腸炎、結腸癌、腸惡性淋巴瘤、發酵性消化不良、糖裂解酶缺乏症。
2)胃源性慢性腹瀉。
3)胰源性慢性腹瀉。
4)肝、膽道疾病所致的慢性腹瀉。
(2)全身性疾病：糖尿病性腸病、甲狀腺功能亢進症、甲狀旁腺功能減退症、慢性腎上腺皮質功能減退症、垂體前葉功能減退症、卓-艾綜合徵、類癌綜合徵、凡一莫(Verner-Morrison)綜合徵、水電解質平衡失常、尿毒症、糙皮病、低丙種球蛋白血癥、免疫球蛋白A重鏈病、硬皮病等。
(3)功能性疾病：結腸激惹綜合徵、神經官能性腹瀉。
常見疾病
l.炭疽 這種疾病起因於進食感染炭疽桿菌的肉類，早期症狀包括食慾減退、噁心、嘔吐、發熱。後期表現為嚴重的血便、腹痛。
2.類癌綜合徵 嚴重的腹瀉常伴有頭頸部潮紅，主要是因為進食刺激性的食物熱水或酒精，其症狀和體徵主要表現為腹部絞痛、厭食、體重減輕、乏力、心臟疾病及抑鬱。
3.痢疾 進食痢疾 桿菌感染的水及食物後，患者表現為急性水樣便及嘔吐，其他還有口渴(由於水、電解質丟失)、乏力、肌肉絞痛、皮膚彈性降低、心動過速、血壓減低，在不進行治療的情況下數小時內可死亡。
4.艱難梭菌感染 患者可能無症狀或發現糞便不成形，或水樣便伴惡臭、膿血、腹痛、腹肌緊張、發熱、白細胞升高，嚴重者，可進展為中毒性巨結腸、腸穿孔及腹膜炎。
5.Crobn病 這種疾病常可導致腹瀉、腹痛，伴隨腹肌緊張、噁心，患者也可有發熱、寒戰、乏力、厭食、體重減輕的表現。
6.大腸桿菌感染 患者進食生肉或其他食物中含有這種菌，可導致水樣便及血便、噁心、嘔吐、發熱、腹部絞痛，在年齡<5歲的小兒童、少年及老年人則可出現血尿，最終導致急性腎衰。急性腎衰為大腸桿菌O157：H7感染的併發症之一。
7.感染 急性細菌、病毒感染及潛在感染如幽門螺旋菌感染可引起突發的水樣便及腹痛或噁心、嘔吐、發熱，嚴重的水、電解質丟失可引起脫水的表現及休克。慢性結核菌、真菌及寄生蟲感染引起的腹瀉症狀輕，持續時間長，伴有消化功能紊亂、噁心、體重下降，有可能出現黏液膿血便。
8.腸梗阻 不完全性腸梗阻增加了腸壞死的可能，其可導致腹痛、腹瀉、瘦肌緊張、噁心及腹脹。
9.腸易激綜合徵 便秘與腹瀉變替，表現為腹痛、腹脹、食慾減退，噁心。
10.缺血性腸壞死 這種疾病可導致血便及腹痛，嚴重者可有休克發生，需要手術治療。
11.乳糖不耐受 腹瀉可在進食牛奶或乳製品數小時後發生，伴隨症狀有腹痛，痙攣、腹脹、噁心。
12.大腸癌 在這種疾病中，部分性腸梗阻常可出現血便。還可有腹痛、體重減輕、乏力、呼吸困難，食慾不搬及抑鬱。
13.李斯特菌感染 這種感染通常由於進食被李斯特菌汙染的食物，主要影響孕婦、新生兒及免疫缺陷人群。典型表現包括腹瀉、發熱，腹痛、噁心、嘔吐、肌痛，當感染波及中樞神經系統則可出現頭痛、發熱、意識政變、頸項強直及腦膜炎。
其他病因
1.藥物 許多抗生素如氨苄西林、頭孢菌素、四環素、克林黴素可引起腹瀉，其他藥物還有抑酸劑、秋水仙鹼、乳果糖、丹曲林、甲芽那酸、甲氨蝶呤。
2.食物 含有某種油類的食物可抑制食物吸收導致急性腹瀉及飢渴。
3.中草藥 如銀杏、人參、甘草可導致腹瀉。
4.中毒 腹瀉與便秘交替伴有腹痛、厭食、噁心、嘔吐，患者常有頭痛、頭暈、金屬味、齒齦炎。
5.治療
胃切除術、胃腸切除術、幽門成形術可導致腹瀉，高劑量放療也可導致腹瀉發生。
