原因一、
臨床認為前列腺的增生使前列腺管內壓力增加，腺管內分泌液鬱滯，鹽類成分在前列腺周圍受壓的皮質或外科包膜上沉積，因此形成前列腺結石。
原因二、
臨床認為結石的形成是由於前列腺腺泡和排洩管發生了慢性炎症，使腺泡擴張，前列腺管狹窄，尿液反流後一些鹽類沉積在正常前列腺腺體組織上，形成前列腺結石。
原因三、
臨床認為前列腺結石是圍繞一個有機物核心，像滾雪球一樣逐漸增大的。這種有機物核心經常是血塊、細菌、壞死組織或一種叫“澱粉樣體”，的物質。當尿液流經尿道時，因一些原因可從前列腺管口反流到遠端的前列腺管，尿中的鈣鹽結晶，如磷酸鈣、磷酸鎂、碳酸鈣、碳酸鎂或草酸鈣等無機鹽可逐層沉積於有機物核心上，逐漸增大，形成結石。
外源性結石的形成與尿液在前列腺內的反流有關。結石常伴有前列腺的灶性慢性炎症改變，有圓形細胞浸潤，腺泡中充滿脫落的上皮細胞和碎片，結石較大者前列腺管和腺泡可出現擴張，周圍有囊腔，其壁內無上皮細胞覆蓋，腺泡間有圓形細胞浸潤及纖維化。
雖然說，醫學界對前列腺結石的明確病因還沒定論，但上文介紹的3個病因與前列腺結石有直接的關係。對前列腺結石進行治療，一般來說就是針對上述的3個病因提出解決辦法。另外，患者在愈後要做好預防措施，防止復發。
