感染人類的流感的叄種病毒中,有兩種也感染豬隻。其中甲型流感病毒普遍見於豬群,而C型則很少見,且還沒有關於B型流感病毒感染豬隻的報導。在甲型和C型流感病毒中,發現於豬和人的病種之間有很大的區別,雖然由於基因重組,已經存在交叉於豬、禽、和人不同物種的毒株之間基因系列的互相傳遞。
1.C型流感
C型流感病毒可同時感染人類和豬類,但不感染禽類。人和豬交叉感染曾經發生過例如,C型流感曾在日本及加利福尼亞引發小規模輕微小兒流感。鑑於C型流感病毒之宿主(即寄養群)的極限以及其基因變種的稀少,這種流感沒有導致在人類中爆發。
2.甲型流感
豬流感已經被確認是由於甲型流感的H1N1、H1N2、H3N1、H3N2和H2N3的亞型變種造成,全世界最常見的是三種原於甲型流感的病毒(H1N1、H3N2及H1N2)。1988年以前,在美國唯一流行於豬隻間的是H1N1亞型病毒,從1998年8月底至今,H3N2亞型病毒己從豬隻中提取出來。到2004年為止,從美國豬隻及火雞中提取出來的H3N2病毒包含了人類(HA、NA及PB1)、豬(NS、NP及M)及禽(PB2及PA)的三類毒株基因的三重交叉組合。