尿道結石可以依據結石的形狀、大小、位置和尿道原發病變選擇不同的治療方案。結石位於憩室內，可同時行憩室切除和尿道修復。治療方法為手術切除尿道憩室同時取出結石。臨床上發生於尿道的結石大多來自於其上的泌尿系統，尤其是膀胱，也可發生在尿道憩室內。石頭非常硬，男性病人中結石主要嵌頓於前列腺部的尿道、尿道舟狀窩或外尿道口。尿道結石患者排尿時的尿線極細，甚者發生尿瀦留。而且結石嵌頓的部位疼痛，同時伴有下尿路感染。觸診時常可觸及前尿道的結石。有的患者甚至經尿道口見到結石，尿道憩室內繼發的結石，排尿時可無任何不適及尿流改變，但尿道口有分泌物，同時也可觸及結石。
尿道結石的詳細治療原則
一、藥物排石法
成功率低、時間長，極容易造成梗阻感染，並可能拖累病情致腎功能減退，嚴重者甚至喪失腎功能。缺點很多。
二、體外衝擊波碎石法
體外碎石是大家熟悉的治療尿道結石方法，應用臨床以來，使許多患者免於手術之苦。體外碎石使用於各種類型腎結石，包括鹿角狀結石、多髮結石、雙腎結石等，腎盂出口處單個結石最適合，腰5橫突以上的輸尿管結石，病程不超過6周。體外碎石有60～70%尿道結石病人可以取得良好療效，但約有 30～40%的結石病人不適合於碎石治療，其中尿路排石不通暢是主要原因。
三、經尿道腔內窺鏡下鈥激光碎石治療
內窺鏡鏡下鈥激光碎石是從尿道里插入輸尿管鏡直到輸尿管結石處，用特製套石網將結石套牢，並經輸尿管鏡操作孔導入激光光纖，接觸結石，將大的結石碎成小碎塊再取出。通過輸尿管鏡還能檢查輸尿管內的病變，能同時切除輸尿管內的息肉、腫瘤等，使管腔通暢，更有利於結石的排出。尿路結石絕大部分可以通過腔內激光治療，大大減少了手術對人體的傷害，提高了安全性及對機體影響少、創傷小、恢復快、痛苦小、住院時間短(一般術後住院2～3天)，出院後不影響工作、生活等優點。
四、經皮腎鏡碎石取石
腎結石引起腎盂積水的情況下，可以在B超或X線引導下，經皮膚微穿刺到腎盂，建立腎盂與皮膚之間的通道。然後經此通道，置入腎鏡並導入鈥激光或超聲清石系統進行碎石和取石。尤其適用於腎盂多髮結石及鹿角狀結石合併腎積水的患者，碎石效果好，創傷小，較傳統開放手術出血少，恢復快，但對醫生的技術要求高，手術風險相對小。
五、開放性手術治療
泌尿系切開取石，是種傳統的手術方式。現已很少使用開放手術，已逐步地被微創碎石取石所替代了，在臨床上已很少採用開放性手術治療。
