滴蟲性陰道炎的治療方法很多，也有效，但往往不易徹底治癒。治療必須針對陰道滴蟲的生活特點(包括抗藥性及宿主機體的情況)，選擇適宜的療法才能獲得理想的療效。
一、局部治療
(一)增強陰道的防禦能力：用0.5～1%乳酸或醋酸或1∶5000高錳酸鉀溶液沖洗陰道，或加用葡萄糖粉撒入陰道，以恢復陰道的正常生理防禦功能，抑制滴蟲的生長繁殖，以達到預防發病的目的。
(二)抗滴蟲藥物：滅滴靈(metronidazole)片劑200～400mg或栓劑(0.5g)，於陰道沖洗後放入陰道，每晚1次，10天為1療程。或用卡巴砷(carbarson)200mg或滴維淨(devegan)1片，用法同上。為了預防復發，並於第二、三次月經乾淨後重複用藥1周。同時取陰道分泌物檢查，經連續3次檢查均陰性者為治癒。
二、全身治療
由於滴蟲在人體內多處寄生的特點，滴蟲性陰道炎患者常伴有腸道或泌尿系滴蟲感染。因此，滴蟲不僅可寄生在陰道及陰道粘膜的皺襞內，還可寄生在泌尿道及宮頸腺體的深處。單純局部用藥不易徹底根治，往往需要結合全身用藥治療。滅滴靈為高效殺滅滴蟲的藥物，口服吸收好，療效高，毒性小，應用方便，男女皆宜，滅滴靈200mg，每日3次，共用7天;同時每晚用滅滴靈200mg作為陰道坐藥。近年，應用滅滴靈2g，作一次性投藥，比200mg每天3次連服7天效果好。單次量經濟、可靠，療效高，病人用藥後24小時內不能飲用含酒精的飲料。一次大劑量無效者，可改用0.5～1g，每日2次，共7天。必要時可做滅滴靈敏感試驗，如屬敏感者再投藥效果更好。
服滅滴靈後，特別是大劑量一次性投與，個別人可出現噁心、嘔吐、眩暈及頭痛或皮疹、粒細胞減少等。早孕期服用，有導致胎兒畸形的可能，故在孕20周之前以局部用藥為宜，應避免口服。曲古黴素對滴蟲、黴菌、阿米巴原蟲等都有抑制作用，必要時可口服曲古黴素10～20萬U，每日2次，服5～7天。在治療期間應注意衛生，避免性交，每天換內褲，對反覆發作的患者，應令其愛人同時治療，口服滅滴靈，用法同上。
