遺傳因素(25%)：
引起寶寶溼疹病因是複雜的，其中過敏因素是最主要的，所以有過敏體質家族史(如父親、母親、祖父、祖母、外祖父、外祖母、兄弟姐妹等家庭成員有過溼疹、過敏性鼻炎、過敏性皮炎、過敏性結膜炎、哮喘、食物過敏和藥物過敏等)的寶寶就容易發生溼疹。
機體對蛋白不耐受(25%)：
大約20%的嬰兒會對奶蛋白產生不同程度的不耐受現象，常表現為不同程度的溼疹，嚴重者可出現腹瀉， 甚至便血。一般嬰兒只是對牛奶蛋白不耐受，但個別孩子對母乳蛋白也不耐受。這種不耐受表現多於生後1～2月開始，逐漸加重。生後4個月左右往往達到高峰。 隨著輔食的添加，情況多開始好轉，一般2歲左右逐漸消失。但有些孩子皮疹會越來越重，今後出現食物過敏、過敏性鼻炎，甚至過敏性哮喘。
誘發因素(30%)：
發生了溼疹的寶寶，許多物質又會誘發或加重溼疹症狀，如食物中蛋白質，尤其是魚、蝦、蛋類及牛乳，接觸化學物品(護膚品、洗浴用品、清潔劑等)、毛制 品、化纖物品、植物(各種植物花粉)、動物皮革及羽毛、發生感染(病毒感染、細菌感染等)、日光照射、環境溫度高或穿著太暖、寒冷等，都可以刺激寶寶的溼疹反覆發生或加重。
有一種特殊類型的小兒溼疹，好發生在孩子的肛門周圍，常伴有蟯蟲感染，稱為蟯蟲溼疹。
