誤區一：泡得越久越好。這是最常見的一個誤區。很多人認為酒是“陳年的香”，從前一年就開始泡今年用的藥酒。其實，如果室溫在20℃左右，較為乾燥的條件下，藥材浸泡的時間大多應為15—30天。浸泡的時間主要和藥材的質地有關，枸杞子泡酒後如果發現酒顏色變紅，說明藥效已經泡出來了;如果是動物類的藥材如海馬、蛤蚧等，泡製的時間需要更長，但由於它們帶菌可能更多，因此泡好後更應儘快喝完。如果是泡藥酒有經驗的人，可在泡製過程中倒出來一點品嚐是否出味兒，但注意不要直接對著瓶口喝，這樣會汙染剩下的酒，加快變質。
誤區二：所有藥材都適合泡藥酒。不是所有的藥材都適合泡藥酒，礦物類的中藥中的有效成分很難用酒泡出來。如果是以毒蛇為原料浸泡藥酒，則需要在中醫師的指導下選用。一般認為毒蛇在浸泡前應去頭，否則極易造成中毒。泡藥酒要選用中藥炮製品，如何首烏生品具有潤腸通便的作用，只有炮製後才能起到養血滋陰、烏髮的作用。如果要選用多種藥材，一定要根據中醫開具的藥方配置，不要隨意用多種藥物泡酒。
誤區三：藥材放得越多越好。酒與藥材的重量比應為10︰1—20︰1。質地較鬆散的藥材吸水性強可以多加些酒，如枸杞子可加20倍酒進行浸泡;質地堅實的藥材吸水性差可以少加些酒，如人參可加10—15倍酒浸泡即可。一般要達到每10毫升酒中含有0.5—1克原藥材。每次飲酒20—30毫升(一小酒杯)，每日飲酒2—3次。因此，有合適容器的情況下第一次以泡製2升左右為宜，取出藥材後應在一個月左右喝完。
誤區四：選用過低度數的白酒。一般建議選用50—60度的白酒，這個濃度的白酒能殺死藥材中存在的微生物，同時更容易使有效成分溶出。隨著酒精的揮發和藥材中水分的溶出，藥酒中酒精的濃度會降低。待泡至可以飲用時，藥酒大致在38度左右，口感溫和。黃酒和米酒本身就有藥用價值，也可用作泡酒的原料。需要注意的是，由於酒精的濃度比較低，這兩種酒一般需要加藥材一起煮沸後再裝瓶，這樣能起到一定的殺菌效果。另外，煮好後最好立即服用，既避免帶菌也趁熱保證藥物的溶出。
誤區五：泡酒期間不攪拌。泡藥酒應選用新的深色玻璃容器，不應用塑料製品。泡製期間，需每日搖晃或攪拌一次，一週後改為每週攪拌一次。如急於飲用，可將藥材切碎浸泡。在泡酒過程中輕輕晃動酒瓶也能加速藥物的溶解。藥酒飲服90%後，可加酒第二次浸泡。一般不會向已經泡好的酒中再次添加藥材，一是因為濃度不易把握，二是因為容易變質。
誤區六：藥材反覆使用。藥物經兩次浸泡後，絕大部分有效成分已經溶出，此時普通藥材即可廢棄掉，如果藥材比較珍貴，如冬蟲夏草，可再用普通煎煮中藥的方法獲取一定的有效成分。
