(1)足葉草脂 該療法適用於溼潤區域的溼疣，例如發生於包皮過長而未曾作包皮環切手術的龜頭溼疣。用20%足葉草脂酊劑塗到皮損處，或用藥前先用油質抗菌藥膏保護皮損周圍的正常皮膚或黏膜，然後再塗藥。用藥後4～6小時，用30%硼酸水或肥皂水清洗。必要時3天后重複用藥。該藥是國外用於該病治療的首選藥，一般用一次可愈。但有很多缺點，如對組織破壞性大，使用不當可引起局部潰瘍;毒性大，主要表現為噁心、腸梗阻、白細胞及血小板減少、心動過速、尿閉或少尿，故使用時必須謹慎，發現上述反應時，應立即停藥。
(2)殺病毒藥物目前主要是以大環三萜類為主，其主要治療的原理為，大環三萜可殺死潛藏在皮膚黏膜中的HPV病毒。此類藥物治療的療程長，疣體脫落比較慢，但複發率很低。此類藥品治療的優點是副作用很小，安全性很高，不會對正常的皮膚造成損傷，治療後不會有瘢痕，對於男性尿道內，口腔內，直腸內尖銳溼疣的治療是一個很好的選擇。
(3)腐蝕劑或消毒劑常用30%～50%三氯醋酸，或飽和二氯醋酸，或18%過氧乙酸。用10%水楊酸、冰醋酸或40%甲醛、2%液化酚、75%乙醇蒸餾水100ml混合溶液，點塗局部，用於龜頭、肛周溼疣，每日或隔日一次，效果很好。消毒劑可用20%碘酊外塗，或2.5%～5%碘酊注射於疣體基部或用新潔爾滅外塗，或以0.1%～0.2%外敷，後者需配合全身療法。
(4)抗癌藥①5-氟尿嘧啶(5-Fu)：2.5%～5%氟尿嘧啶溼敷治療陰莖、肛周尖銳溼疣。也可用聚乙二醇作基質，加入佔其幹質5%的5-Fu粉劑製成栓劑，治療男性尿道內尖銳溼疣。也可用5-Fu基底注射，多者可分批註射。②噻替哌：主要用於5-Fu治療失敗的尿道內尖銳溼疣，副作用有尿道炎。亦可用該品10mg加入10ml生理鹽水浸泡患處，治療男性陰莖、龜頭冠狀溝溼疣。主要用於經其他方法治療後，尚有殘存疣體或復發者。也可將此溶液再稀釋兩倍浸泡局部，以預防復發。③秋水仙鹼：可用2%～8%的生理鹽水溶液外塗，治療陰莖溼疣，塗後可出現表淺糜爛。
