1、男性生殖系統疾病：包囊炎，包莖，陰莖硬結症，陰莖發育不全等都會導致男性不育。
2、藥物：市面上流通的幾乎所有抗高血壓藥物均有不同程度引起性功能紊亂的作用。抗精神病藥物與抗高血壓藥物類同。不能濫用藥物。
3、內分泌疾病：各種內分泌疾病是人類的多發病，也是產生器質性性功能障礙十分常見的原因，生殖腺功能低下，甲狀腺功能低下或亢進，腎上腺皮質疾病，垂體疾病都可導致性慾減退。
4、精子運送受阻：附睪及輸精管結核可使輸精管阻塞，阻礙精子通過，陽痿、早洩等性功能障礙都不能使精子進入女性陰道。
5、隱睪症：醫學上將睪丸位置異常或沒有降至陰囊都稱為隱睪症。據統計，約有10%的新生兒和2%的幼兒會發現睪丸位置異常現象。以往認為，只有雙側隱睪才會影響生育，但近年發現，單側隱睪的不育率約佔67%以上。儘管從道理上講，單側睪丸完全可以代償兩個睪丸的作用，但實際上，單側隱睪由於受溫度的不良影響，相應產生抗精子的某種抗體，從而使對側正常的睪丸失去製造精子的作用。這種稱為"血睪障礙"的不育症，發生睪丸腫瘤的機會也比正常男人多，而且，由於傳統觀念的錯誤認識，至今仍未引起人們的重視，一般都是婚後才發現不育，這時治療效果往往不如兒童時期。
6、精液異常：如無精子、或精子數量過少，活動減弱，形態異常。
7、環境影響：坑道內過熱的礦工、鍋爐工等;內衣過緊;過度吸菸酗酒;缺氧情況下，均可影響生育能力，導致男性不育。
8、睪丸後天損傷：如疝氣修補術、鞘膜積液手術、睪丸固定手術等損傷了睪丸血管，阻礙血供而使睪丸萎縮。
9、精子運送受阻：附睪及輸精管結核可使輸精管阻塞，阻礙精子通過，陽痿、早洩等性功能障礙都不能使精子進入女性陰道。
10、鞘膜積液：鞘膜積液壓迫了睪丸血液循環，可導致睪丸感染或萎縮。該病青春期後發病率為16%—19%。
11、內分泌因素：男性內分泌受下丘腦-垂體-睪丸軸調解垂體、甲狀腺及腎上腺素功能障礙所致的少精子症和無精子症均可引起不育。
12、遺傳因素：如性染色體異常的Klinefelter綜合徵、男性Turner綜合徵等。 13、免疫因素：由於精子暴露於免疫系統，精子精漿在體內產生對抗自身精子的抗體，射出的精子發生自身凝集而不能使女性受孕。
14、生殖器官感染：細菌、病毒、原蟲等感染，可以直接損害睪丸，導致辭睪丸萎縮，睪丸結核，破壞睪丸組織，嚴重地影響生精能力及降低精子的活性而導致不孕。例如青春發育前期患腮腺炎有20%併發睪丸炎而造成不育。
15、神經功能障礙以及神經系統疾病所致的不育：如截癱、陽痿。
16、精索靜脈曲張所致不育：精索靜脈曲張可以影響睪丸生精功能從而導致不育，約佔男性不育的 30%～40%。
17、呼吸系統疾病與男性不育：例如Young綜合徵和Kartagener綜合徵，均由於呼吸道粘膜纖毛和精子尾部的超微結構發生異常而導致不育。
18、供血障礙：動脈硬化患者及糖尿病患者，常常伴有睪丸小動脈疾病，使產生精子的能力衰退而引起不育。
19、睪丸異常：睪丸異常有3種情況：1)隱睪，單側隱睪所致不育約為30%～60%，雙側為50%～100%。不僅導致不孕，還可誘發惡變;2)胎兒期因不利的環境因素損傷了胚原基;3)早期睪丸損傷，可因分娩過程中產傷引起。
20、重力影響：男子在從事重體力工作過度負重的情況下，可以使睪丸內生精減少而導致不育。
21、精神心理因素所致不育：患者精神心理狀態的異常，使神經內分泌發生紊亂而導致睪丸生精功能低下，或引起性交功能障礙而引起不育。
22、藥物和放射治療與不育：麻醉藥、鎮靜藥、降壓藥以及激素類藥物不僅可以影響男子性功能，而且也影響睪丸生精功能導致不育。專家提醒：抗癲癇藥對生精有直接的影響。
23、毒性化學物質與不育：現代工業抓發展講效率從而造成的環境汙染，使人類遭受多種毒性化學物質的損害，同時也影響睪丸的生精功能導致不育。此外，我國個別產棉區的農民曾因長期大量食用粗製棉籽油(含有棉酚)後，導致睪丸萎縮而造成不育。專家提醒：治療男性因素引起的不育，首先應該找到引起不育的真正原因，並根據原因採取針對性的治療，以免誤診誤治而加重病情，而加重患者的心理及經濟負擔。
24、精神困擾：精神抑鬱，恐懼心情，神經過敏症均可使性慾低下，非性交行為習慣也存在引起性慾減退。
25、腮腺炎後遺症引起男性不育：流行性腮腺炎病毒，除了在腮腺中"為非作歹"之外，還會在人體的生殖器官、神經組織和胰腺等組織器官裡"惹事生非"。當它侵犯睪丸時，可引起睪丸發炎，其表現為睪丸腫脹和疼痛，伴有發燒、寒戰、噁心、嘔吐等全身性症狀。如果僅出現以上症狀，問題並不很大，嚴重的是流行性腮腺炎病毒會使睪丸組織萎縮，特別是會使專門製造精子的"工廠"--- 精曲細管的機構遭到破壞。如果雙側睪丸都被這種病毒破壞的話，就會引發終生不育，而且是難以治癒的。據統計，由於睪丸功能衰竭而致男子不育者佔到14%左右，其中大部分都是腮腺炎引起的睪丸炎症所致。
26、慢性疾病與不育：如甲狀腺疾病、肝臟疾病、糖尿病、腎功能衰竭等均可導致不育。
