1.與男，女性淋病鑑別的疾病
(1)非特異性尿道炎：常有明顯的發病誘因，如插導尿管，尿道探子，泌尿生殖道或鄰近器官的炎症等病史，分泌物塗片染色可檢出Gram陽性球菌。
(2)NGU：臨床症狀與淋病類似，但較輕，潛伏期比淋病長，達1～3周，分泌物量少且呈漿液性，排尿困難極少見，無全身症狀，取分泌物作檢查時常可發現衣原體或支原體。
(3)軟下疳：損害一般位於外生殖器部位，發生於尿道口，舟狀窩者有膿性分泌物，尿道口紅腫和劇痛，潰瘍處可檢出Ducrey嗜血桿菌。
(4)生殖器皰疹：為HSV引起，損害為集簇性水皰，一般位於外生殖器，肛周，偶見於宮頸，發生於尿道者可有少量分泌物及尿道刺痛或不適，常伴局部燒灼感，疼痛明顯，可反覆發作。
(5)固定型藥疹：有服藥或注射用藥史，多由磺胺類，巴比妥類，水楊酸鹽類或四環素類等引起，常於外生殖器皮膚黏膜交界處發生紅斑，水腫，水皰，糜爛及滲出等，伴瘙癢或疼痛，尿道口無紅腫及外翻等。
(6)結核性尿道炎：可有尿道刺痛及少量分泌物，但無性接觸史，查不到淋球菌，可查見結核桿菌，伴有其他部位結核的症狀。
2.與男性淋病鑑別的疾病
(1)包皮龜頭炎：常見於包皮過長或包莖者，多由包皮垢刺激及繼發化膿菌感染所致，包皮內葉，龜頭及冠狀溝紅腫，有較多的汙垢及膿性分泌物，無泌尿道症狀及尿道口紅腫，流膿等。
(2)尿混濁：尿液呈乳白色，靜置後有鹽類結晶的沉渣，不伴有自覺症狀。
3.與女性淋病鑑別的疾病
(1)念珠菌性陰道炎：外陰及陰道口瘙癢，白帶較多，如水樣或凝乳狀，陰道黏膜紅腫，糜爛，可有白膜附著於陰道壁，取白膜塗片鏡檢可見菌絲及孢子。
(2)滴蟲性陰道炎：自覺陰道內有蟻行樣瘙癢，陰道分泌物常呈粉紅色泡沫狀，陰道黏膜多有出血，宮頸可有草莓狀突起物和點狀出血，陰道分泌物中可檢出滴蟲。
(3)細菌性陰道病：主要為頑固性白帶增多，呈灰白色，非化膿性，並帶有“魚腥樣”氣味，從陰道分泌物中可檢出Gardner桿菌和厭氧菌。
(4)幼女金葡菌性外陰炎：多見於學齡前或學齡期女孩，好發於夏季，外陰，肛周紅腫，有膿皰或膿性分泌物，伴疼痛或瘙癢，分泌物塗片可檢出Gram陽性球菌。
4.與GPID鑑別的疾病
有急性闌尾炎，感染性流產，盆腔子宮內膜異位症，異位妊娠，卵巢囊腫蒂扭轉或破裂等。
