急性腎炎現認為有自限性,20世紀初急性腎小球腎炎死於急性期合併症者為5%~10%,如心力衰竭、高血壓腦病及高血鉀或繼發感染。而近年來,死亡率明顯下降,因治療的進展及血液淨化的使用,使大部分併發症可有效控制,現少尿腎衰竭約佔1%,且多見於老年人。而如果急性腎炎急性期尿少、高血壓和氮質血癥不能有效控制者,仍可出現不可逆性腎功能損害。但有大量蛋白尿致NS病人,持續血中纖維蛋白複合物增高及尿FDP增高及腎臟病理改變呈腎小球內上皮細胞增生明顯的患者,如能給予恰當、及時治療及透析治療時,則幾乎全部病人均能自愈存活。本病輕型少兒病人多預後良好,成年人預後較差,但總體預後較好,老年人預後不好,常合併腎病綜合徵、高血壓及腎功能損害。病理方面廣泛大量新月體形成,熒光呈花環狀者預後差,鏡下有不典型駝峰改變的病人預後差。
小兒急性腎小球腎炎預後良好。50年代住院患兒中有報告病死率可高達5%(死於肺水腫、高血壓腦病、急性腎功能衰竭和感染)。近年由於診治水平的提高,住院患兒病死率已降至0.5%~2.0%以下,某些城市已消滅了急性期死亡,其死因主要為腎功能衰竭。絕大多數患兒2~4周內肉眼血尿消失,利尿消腫,血壓逐漸恢復,殘餘少量蛋白尿及鏡下血尿多於6個月內消失,少數遷延1~3年,但其中多數仍可恢復。