過敏性鼻炎如果不治療，不會自愈，反而會有危害。
很多人認為，過敏性鼻炎只是在發病時有疼痛感，但之後就沒有不適感了，就像健康人一樣，所以治療與否並不重要。事實上，過敏性鼻炎如果不及時治療，可能會導致鼻竇炎和鼻息肉，嚴重的還可能引起中耳炎，甚至誘發哮喘。臨床研究結果證實，60-80%的過敏性鼻炎患者可發展為過敏性哮喘。
過敏性鼻炎對身體極為有害。它可以引起頭痛、頭暈、失眠和健忘、心煩意亂和容易發脾氣。學生的學習成績逐漸下降，昏昏欲睡，無動於衷，注意力不集中。它還會成為影響附近組織炎症的病變，特別是眼睛疾病，如中央視網膜炎。
過敏性鼻炎如果不加治療，時間長了，也會惡化，變成癌症。最近在中國臺灣的一項研究證實，過敏性鼻炎患者患鼻咽癌的風險可能增加。研究人員觀察到，相對於對照組，過敏性鼻炎隊列中的參與者患鼻咽癌的風險高出2.33倍。每年有四次或更多的過敏性鼻炎發作的患者，其患鼻咽癌的風險明顯更高。
