1.依據結石的成分分類
(1)草酸鈣結石尿液呈酸性，特點為質硬，不易碎，粗糙，不規則，棕褐色。
(2)磷酸鈣結石尿液呈鹼性，特點為易碎，粗糙，不規則，灰白色、黃色或棕色往往因尿路感染和梗阻而引起。(3)尿酸鹽結石尿液持續酸性，特點為質硬，光滑，顆粒狀，黃色或棕紅色，尿酸代謝異常。
(4)磷酸銨鎂結石屬腎臟感染，特點為光滑，面體或椎體，大多與飲食有關。
(5)胱氨酸結石為罕見的遺傳性疾病，特點為質硬，光滑，蠟樣，淡黃色至黃棕色，因家族性遺傳性疾病。
2.依據結石的部位分類可分為：
上尿路結石包括腎結石、輸尿管結石;下尿路結石包括膀胱結石、尿道結石。
