便秘是由於飲食過於精細，食物殘渣少，形成的糞便少，在腸道內停留時間長，腸道吸收過多水分使大便乾燥，或飲酒、喜食辛辣食物、飲水過少、偏食等不良的飲食行為，或不經常運動，腸道蠕動功能顯著減弱。蜂蜜進入人體胃腸後激活體內益生菌，益生菌開始活躍，合成並釋放各種轉化酶，分解各種食物同時促進胃腸蠕動，從而使人們能進行正常的新陳代謝，促進恢復正常的排洩功能。同樣，由於喝蜂蜜水增加胃腸的益生菌，恢復胃腸內各種菌類的均衡。長期食用可以有效治療和預防便秘。
有經驗的網友在用蜂蜜治療便秘的時候就說到，早起喝，用溫熱水衝，這樣能夠有效治療便秘的情況，注意濃度不要太高，最重要的是要持之以恆。而對於喝蜂蜜水時間宜晚不宜早也只是一個通用的說法，不是適合所有人的，要分個人身體情況而定。例如對於便秘的人來說大便艱難，那麼早起喝蜂蜜水就有助於排便了，對於他來說早上起床後喝蜂蜜水就比較好了。每天早上起來空腹喝溫水衝的蜂蜜水，多喝水，多吃新鮮蔬菜，增加飲食中纖維的攝取量。不吃辛辣刺激性食物，適當運動，能增加腸蠕動，每天定時排便。
