尖銳溼疣潛伏期的症狀表現不明顯，潛伏期過後，開始出現明顯症狀：
男性好發於冠狀溝，包皮，龜頭，繫帶，尿道口，陰莖體，肛周和陰囊。女性尖銳溼疣初期症狀好發於大小陰唇，會陰，陰道口，陰道內，尿道內，宮頸，肛周等處。初起為淡紅色丘疹，漸增大增多，融合成乳頭狀，菜花狀或雞冠狀增生物，形狀大小不一。可有瘙癢，外傷摩擦後出血，疼痛，陰道有分泌物等症狀。繼發感染可有惡臭。
尿道內尖銳溼疣可引起血尿，尿路梗阻等。部分尖銳溼疣病人沒有典型的尖銳溼疣症狀，而表現為亞臨床感染或潛伏(隱性)感染。另外，尖銳溼疣易復發。
