禽流感的症狀因品種、年齡、性別、合併感染的程度、病毒的毒力和環境因素而異，主要表現為呼吸、消化、生殖或神經系統的異常。
常見的症狀包括：病雞精神萎靡，飼料消耗減少，昏昏欲睡；母雞築巢增多，產蛋量下降；輕到重的呼吸道症狀，包括咳嗽、打噴嚏和大量流淚；頭部和麵部水腫，神經紊亂和腹瀉。
這些症狀中的任何一個都可能單獨出現，或以不同的組合出現。有時疾病的爆發很迅速，在沒有明顯症狀的情況下，雞就被發現死亡。
此外，禽流感的發病率和死亡率差別很大，取決於鳥的種類和品系以及年齡、環境和合並感染，通常是發病率高，死亡率低。在高致病性的病毒感染中，發病率和死亡率可以達到100%。
禽流感的潛伏期從幾小時到幾天不等，其長度與病毒的致病性、感染病毒的劑量、感染途徑和被感染鳥類的種類有關。
