食管癌的治療方法包括手術、放療、化療，但是最好的治療是綜合治療。也就是說，按食管癌發生的部位，腫瘤的大小，癌細胞分化程度，有無淋巴結轉移等情況，利用手術、放療和化療的合理優化，組合成綜合治療方案，達到療效最高、毒副作用最小的治療。
手術
手術應該是食管癌首選治療，也是最有效的治療。但是手術治療的食管癌病例，可能只佔食管癌患者的10%～20%。手術要求必須達到原發灶完全切除，並且區域淋巴結達到根治性清掃。食管癌長度超過5cm，80%以上出現縱隔淋巴結轉移;長度超過7cm，100%的病人有縱隔淋巴結轉移。手術時必須做到淋巴結完全、系統的清掃。規範治療的標準是淋巴結切除需達到11個以上，這才能達到標準分期的要求。
適合手術治療的食管癌，即手術治療的適應證，應當是Ⅰ期、Ⅱ期和部分Ⅲ期，腫瘤雖侵犯食管最外側的纖維膜，或侵犯相鄰結構，但只有區域淋巴結轉移的病例。如果首選放療，放療後復發，但沒有遠位轉移，病人可以耐受手術，都可進行手術治療。食管下段癌最宜手術。
不適合手術的食管癌，或稱為手術禁忌證的是Ⅳ期和部分Ⅲ期，侵犯血管、氣管，腫瘤巨大，有遠位轉移的病例。心肺功能差，重要器官功能不全，都不宜手術。
放療
放療是治療食管癌的主力，不能手術的病人，或是可以手術但身體情況不好，不具備手術的醫療條件時，病人拒絕手術自願放療時，都可以行放療。放療治療食管癌可分為根治性放療、同步放化療、術前放療、術後放療、或姑息性放療。
根治性放療目前已經得到廣泛開展。食管癌瘤床及可能播散的亞臨床(顯微鏡下可能看到癌細胞播散的區域)病灶，局部區域淋巴結引流區，都包括在放療照射範圍(靶區)之內，給予根治放療劑量，可以取得相當好的療效。胸上段、胸中段、頸段食管癌手術困難大，療效差，而放療相對容易，療效好，
根據臨床實踐經驗，食管癌放療時同步使用小劑量化療增敏，可以使食管癌放療療效明顯提高。5年生存率最好能達到40%以上。達到極為驚人的效果。
