1)紅細胞破壞太多、太快，膽紅素生成過多
體內的膽紅素約80%是由衰老的紅細胞被破壞而形成的。如果過多的紅細胞的破壞及腸肝循環增加，使血清未結合膽紅素升高，常就會引起新生兒黃疸。母、子血型不合引起的溶血性黃疸就屬於這一類，新生兒生後24小時內就出現黃疸，而且進展很快，皮膚呈現金黃色。常見的病因有：紅細胞增多症、血管外溶血、同族免疫性溶血、感染、腸肝循環增加、紅細胞酶缺陷、紅細胞形態異常、血紅蛋白病。
2)肝臟膽紅素代謝發生障礙
由於肝細胞發炎或肝細胞內缺少一種酶，或這種酶活力低，肝細胞攝取和結合膽紅素的功能會降低，無法很好排洩膽紅素，使血清未結合膽紅素升高，也會引起新生兒黃疸 。出生一週內的新生兒產生生理性新生兒黃疸，就是因肝臟酶活力低下這個原因。常見的病因有：缺氧和感染、Crigler-Najjar綜合症、Gilbert綜合症、Lucey-Driscoll綜合症、藥物(如磺胺、水楊酸鹽、吲哚美辛、毛花苷丙等)。
3)膽汁排洩有障礙
由於膽管阻塞，肝細胞排洩結合膽紅素障礙或膽管受阻，膽紅素不能排洩到小腸，使膽汁淤積在肝細胞或膽道內而引起新生兒黃疸。我們稱它為阻塞性黃疸，同時也肯能伴肝細胞功能受損，也可有未結合膽紅素的升高。常見的病因有：新生兒肝炎、先天性代謝性缺陷病、Dubin-Johnson綜合症、膽管阻塞。
