如果甲狀腺癌第一次手術不徹底或甲狀腺術後殘留的甲狀腺組織又出現結節，且結節較大或懷疑惡性，都需要進行甲狀腺再次手術。
對於首次手術切除不徹底的甲狀腺癌，再次手術的最佳時間是第一次手術的3周內或第一次手術的3月後。因為，在3周內，甲狀腺術後的反應仍以水腫反應為主，這期間術後組織間的粘連還是以疏鬆粘連為主。所以這期間手術，術後的粘連一般都能分離開，因此，一般不會對正常的組織產生損傷。但術後3周後隨著疤痕反應的加重，原來疏鬆的水腫性粘連會被緻密的纖維素性粘連所替代，特別是術後3周到3個月內。緻密的纖維素性粘連一方面可以使正常的喉返神經和甲狀旁腺等組織粘連與任何其他組織上；另一方面也使喉返神經和甲狀旁腺等組織和纖維組織無法區分，因此，一旦形成纖維素性粘連，那再次手術損傷喉返神經和甲狀旁腺的幾率大大增加，再次手術的風險也大大的增大。但對於經驗豐富的醫生來說，一般可以通過一些特殊的檢查，如CT等初步判斷殘留甲狀腺的部位，這樣可以對再次手術的風險有個初步的估計。其次，經驗豐富的醫生應該對因術後粘連所致的喉返神經和甲狀旁腺的解剖部位變異有更深刻的瞭解，因此，相對來說可以降低再次手術的風險。
