激光矯正手術的安全性和醫生的操作經驗、設備有關。手術並不是零風險，主要要避免兩個術後併發症。任何角膜做手術有傷口，就會有感染的機會。
導致近視眼手術後遺症的出現，有些是角膜復原後傷口暴露在空氣中，如果不注意衛生會造成發炎、感染。治療近視是讓角膜變平，但過於平的角膜會受到來自眼睛內部壓力的擠壓，使角膜往前隆起，這種壓力人是感受不到的，但後果是不僅沒有治療近視反而會加重近視，甚至產生不可逆的散光。
第一，導致近視眼手術後遺症的發生，有些是在手術前醫院沒有仔細篩選排除那些先天性眼病患者。
第二，是雖然篩選出合格的患者，醫生在手術操作時，手術尺度不合適。比如應該保留一定的角膜厚度，但有些醫生想完全矯正高度近視患者的視力，將角膜削得過薄，導致不良後果。
