精液異常的檢查方法很多，以下是患者常做的精液的生化檢查：
精液的生化檢查目前開展較多的是果糖、酸性磷酸酶、檸檬酸、蛋白質、微量元素等。做精液的生化檢查時，精液標本要置於35℃-37℃水浴箱內，液化後取1.2-1.5男性精ml離心15分鐘，取上層精漿作生化測定。
1、果糖的測定：一般用間苯二酚法，正常值為256±104mg/dl。果糖主要由精囊分泌，為男性精子能量代謝的主要來源，與男性精子活率有關。果糖為零，應考慮精囊缺如。精囊有炎症時，果糖含量下降。此外，雄激素不足及老年時果糖含量降低，糖尿病時精漿中果糖含量較高。
2、酸性磷酸酶：用β-甘油磷酸法測定。正常值為882±412布氏單位/ml。該酶主要來自前列腺。與男性精子的活力和代謝有關。前列腺炎時，精漿中酸性磷酸酶含量下降;早期前列腺癌或良性前列腺肥大，酸性磷酶含量常增高。
3、檸檬酸：通過Furthherrmann反應測定，正常值為56±2.0mg/dl，主要來自前列腺，調節精液中鈣離子濃度，影響精液的液化，具有前列腺酸性磷酸酶激活劑作用，從而影響男性精子活力。前列腺有炎症時，檸檬酸含量顯著減少。
4、蛋白質：用雙縮尿法測定。正常人為3.6±0.8g/dl。精液中的蛋白質主要來自精囊、前列腺，可促進男性精子活力，保護男性精子免受環境的有害作用。
5、微量元素：對男性生殖和生殖內分泌功能有重要作用。正常精液中鋅為130±56μg/ml，銅：1.85±0.15μg/ml，鐵：0.81±0.04μg/ml。精液中的鋅能影響男性精子代謝，和男性精子活動力、密度成正比關係，且能通過影響腦垂體再間接地影響性腺，當鋅不足時，垂體促性腺激素分泌減少，使性腺發育不良，或使性腺的生殖和內分泌功能發生障礙。銅能影響男性精子存活率及活動度，精液中銅濃度高，男性精子活動度較差。反之，則良好。鐵與精液中男性精子密度有明顯關係，精漿中含鐵則男性精子密度較高，反之，男性精子密度低。
6、男性精子特異性酶-乳酸脫氫酶X(L-DHX)、LDH同功酶具有相對的組織特異性，與生精功能有一定關係。服用生棉籽油過多時的男性不育症患者此酶降低。
