1.上消化道出血
上消化道出血是消化性潰瘍的最常見併發症。20%至30%的潰瘍病患者有出血史，十二指腸潰瘍的出血比胃潰瘍的出血更常見。據統計，在上消化道出血的各種原因中，潰瘍約佔50%，居首位。大多數消化性潰瘍和出血可以自行停止。胃潰瘍的出血量比十二指腸潰瘍多。出血往往發生在消化性潰瘍出現後的1到2年內。
2.潰瘍穿孔
消化性潰瘍穿孔在臨床上可分為急性、亞急性和慢性。十二指腸潰瘍的發病率比胃潰瘍高。十二指腸潰瘍穿孔多見於40歲以下的青壯年，而胃潰瘍穿孔則多見於50歲以上的中老年人。
3.幽門梗阻
約10%的消化性潰瘍患者可能有幽門梗阻，多見於十二指腸潰瘍，其次為幽門管或幽門前潰瘍。幽門梗阻併發的消化性潰瘍在老年人中更常見，並且以男性為主。近年來，由於各種有效的抗潰瘍藥物的廣泛使用，這種併發症已明顯減少。幽門梗阻有兩種類型：器質性和功能性。前者是由於慢性潰瘍引起的粘膜下纖維化，導致瘢痕性狹窄，經藥物治療無效，常需手術治療；後者是由於潰瘍周圍組織的炎症引起充血水腫和幽門反射性痙攣，經藥物治療有效。
4.癌變
慢性胃潰瘍是否會癌變，目前仍有爭議。大多數學者認為，癌性胃潰瘍確實存在，其癌變率估計為1%至7%。癌性胃潰瘍常常發生在潰瘍的邊緣，而十二指腸潰瘍一般不會發生癌變。
