1、根據潰瘍癒合的時間進行判斷
良性口腔潰瘍一般僅需數天至數週就可以癒合。惡性口腔潰瘍則呈進行性發展，數月甚至一年多都不癒合。
2、根據潰瘍面的形態進行判斷
良性口腔潰瘍一般形態比較規則，呈圓形、橢圓形或線條形，邊緣整齊，與周圍組織分界清楚，潰瘍面的基底部較平滑，觸之柔軟，疼痛明顯。惡性口腔潰瘍形態多不規則，其邊緣隆起呈凹凸不平狀，與周圍組織分界不清，潰瘍面的基底部不平整，呈顆粒狀，觸之硬韌，和正常黏膜有明顯的區別，疼痛不明顯。
3、根據病程規律進行判斷
良性口腔潰瘍經常反覆發生。惡性口腔潰瘍常不會復發，而一旦發病就遲遲不癒合。
4、根據患者對藥物的敏感程度進行判斷
良性口腔潰瘍患者一般在應用消炎防腐類藥物進行治療後效果明顯，癒合較快。惡性口腔潰瘍患者若應用此類藥物進行治療，療效常不明顯。
5、根據患者的全身情況進行判斷
良性口腔潰瘍患者較少出現全身症狀，頸部淋巴結不腫大，或雖腫大但不硬、不粘連。惡性口腔潰瘍患者則相反，可出現發熱、頸部淋巴結腫大、食慾不振、消瘦、貧血、乏力等表現。
