所謂“單純HPV陽性”是指宮頸細胞學或液基細胞學、宮頸活檢後病理診斷均為陰性（也就是“正常”或“慢性炎”一類），僅僅HPV檢測為陽性，或某個，或某幾個亞型為陽性。
首先，應該注意的是HPV的檢測方法。
HPV的檢測方法有很多種，常見的有用細胞塗片或活檢組織做免疫組化、原位雜交或用陰道分泌物基於PCR的DNA或mRNA檢測。前2種主要用於病理科，臨床一般常用的是第3種方法。臨床常用的第3種方法，是取陰道分泌物，通過PCR或某種信號放大技術進行檢測。這種方法非常的靈敏，特別是PCR技術，理論上可以檢測1個拷貝（copy）的病毒DNA。全球大規模調查發現，如果用PCR技術檢測HPV，在正常人群中大約可以有20-40％的陽性。
為了解決這個問題，目前臨床上檢測HPV的方法，通常需要設定一個閾值（如下圖）。閾值設定的原理是儘可能包含所有的發病者，而不僅僅是技術能夠檢測到病毒DNA。每種不同的檢測方法，其設定的閾值是不盡相同的，但都是通過大規模的臨床病理對照，通常是在全球範圍內進行幾十萬分或百萬分調查後設定的。美國FDA批准上市能夠應用的HPV檢測方法有HC2，Cervista，Cobas和Aptima，共4種。其中，前2種不能進行分型，後2種可以檢測14種高危HPV亞型，並能單獨分出HPV16和18亞型。目前，國內臨床進行HPV檢測的方法至少有30個以上，我們不能夠通過文獻找到這些方法是如何設定閾值的。如果閾值設定的不合理或過低，如下圖黃線顯示的，從技術上看，確是是檢測到HPV DNA了，但卻包含了大量的“正常攜帶者”。
因此，當你拿到一份HPV的檢測報告時，首先，你需要確定，你的檢測用的是甚麼方法。分辨它們其實也很簡單。國際通行的檢測方法中，HC2的檢測結果為一個數值，Cervista為分組，cobas和aptima只能分出16和18亞型，其它12個亞型是不分的。如果不是這樣的結果，就不是國際通用方法檢測的。
其次，即便是真實的HPV陽性，天也塌不下來。
因為，HPV感染具有自限性。也就是說，像其它的病毒感染一樣，如感冒，能夠自行恢復，因而，HPV感染常常表現為“一過性”感染。如下圖，黑色柱表示HPV感染率，在15-19歲，30-34歲這2個年齡段HPV感染率最高，這對應了性活動高峰年齡段。但每個年齡段至少有1/3的可以被自行清除，如灰色柱表示的，大部分年齡段的清除率在50％以上。也就是說，有30-50％以上的機會，HPV感染是可以自行清除的。這主要是依賴機體的局部免疫功能，而目前並沒有有效的針對病毒的治療藥物。
HPV的清除是需要時間的。大約50％的人可能在半年內轉陰，70-80％可能在1年內轉陰，而剩餘的20-30％可能需要2-3年的時間才能變為正常。因此，短時間內不需要反覆去做HPV測試，因為不會在短期內消失。
最後，需要注意的是，由於各種不同的原因，部分人HPV可能變成持續性感染。HPV的持續性感染是導致病變的最危險因素。
正常情況下，機體可以通過局部免疫系統清除病毒。因此，當機體局部免疫功能受損，如合併其他炎症，尤其是其它病毒感染如皰疹病毒、鉅細胞病毒等，容易使感染持續。當整個機體處於免疫抑制狀態，如合併紅斑狼瘡、腎移植等使用免疫抑制劑、使用抗腫瘤藥物等，也肯定容易成為持續感染。合併感染HIV（艾滋病），則肯定容易導致宮頸癌的發生。因此，要能夠清除體內病毒，保持健康的生活方式，使機體免疫功能保持正常狀態，保持局部清潔衛生防止出現其它感染等是非常重要的，比各種所謂的抗病毒藥物要有效的多。
一般情況下，當病毒持續2年依然陽性，就需要進行檢查了。這裡需要注意的是，是相同類型的HPV，比如HPV16型。而如果現在是HPV的其它型，2年後查到的是HPV16型，這個是表示出現了一次新的感染，而並非持續感染。
現行的HPV檢測方法，通常都是檢測HPV的高危型（能夠導致宮頸癌的HPV類型），而一般的低危型是意義不大的。如果檢測出現HPV16和18同時陽性，是需要進行進一步檢查的。
簡單的說，當宮頸細胞學檢查為陰性，宮頸活檢做病理檢查也為陰性，僅僅為HPV檢測陽性，這並不說明存在病變，而常常僅為病毒攜帶狀態。由於國內不同醫院多種檢測方法並存，可能大幅度增加了這種情況。即便真的HPV陽性，在多數情況下，也能夠被機體清除，HPV的感染是自限性的。HPV的分型是有意義的，如果僅僅是低危病毒（HPV6/11）感染，是不需要治療的，等待自然康復，但如果是HPV16和18同時感染，是需要到醫院進一步檢查的。
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