子宮性閉經：由於子宮內膜對激素不起反應或反應低下而引起。多見於子宮內膜結核、子宮內膜損傷(如刮宮後子宮內股不再生)、子宮內膜粘連及發育不良等。這種病人即使通過人工的激素調節(人工週期)，子宮內膜也不會脫落出血。
卵巢性閉經：主要由卵巢疾病所引起。由於雌激素水平過低，不能促使子宮內膜生長，如先天性卵巢發育不良、卵巢早衰、無反應卵巢等。這些人體內雌激素水平低而促性腺激素卻正常或偏高，可應用人工週期治療。
垂體性閉經：閉經與垂體功能不足有關，可見於顱腦損傷、席漢氏綜合徵、顱腦部放射治療後等。
下丘腦性閉經：問題出在下丘腦，可以是神經系統器質性疾病，如炎症、腫瘤、缺血等造成的，也可以是精神因素、環境改變、全身疾病、營養不良及藥物影響造成的。
