我的孩子早上醒來時，感到腿部後部從腿彎處到生殖器兩側的疼痛。

這可能是生長痛。生長痛通常發生在學齡兒童身上，主要是夜間小腿或膝蓋周圍的疼痛，以及腿彎處的疼痛。如果不是很明顯，不需要特殊治療。但如果疼痛難以忍受且比較明顯，可以選擇輕度按摩。

這種情況一定要了解，如果有明顯的外傷，或者是筋膜炎引起的，還是建議根據你的實際情況做一些檢查，如果有生殖器的疼痛，這種情況不排除有鞘膜積液。或者是睪丸的問題，還是要看採取超聲檢查。明確診斷，進一步治療？通過B超來進一步分析情況，分析你的病情變化。

可能是由於孩子身體的這種過度反應，也可能是處於骨骼生長髮育階段的缺鈣，也會引起這種情況，所以我建議你還是多注意觀察，或者在近期給孩子補充營養，特別是維生素D，這是最好的方法。