新生儿破伤风是严重威胁新生儿健康乃至生命的传染性疾病，在许多发展中国家，新生儿破伤风是造成婴儿死亡的重要原因之一。部分患儿可由于缺氧、窒息、继发感染而死亡。严重缺氧可致脑细胞缺氧坏死，存活者智力会受到一定的影响。
判断本病的严重程度，主要根据以下各点：
1.潜伏期的长短 潜伏期短，说明细菌的毒力强，产生的毒素多，故病情重。潜伏期短于6天者，预后多较严重;有资料表明，潜伏期短于6天者，其病死率为44.4%(11/25)，而潜伏期长于6天者，病死率仅为20%(4/20)，一般认为，潜伏期长于10天者，大多数能够治愈。
2.抽搐发生的时限 指开始发病至抽搐的时限。这个时限越短，病情越重，时限在24h内与长于24h，其病死率有显著性差异。3.抽搐的频率及程度 这是判断严重性最主要的指标。抽搐越频，每次抽搐持续时间越长，病情越严重。
4.呼吸窘迫及发绀 严重破伤风病人，除频发抽搐外，往往有呼吸窘迫及发绀反复出现。产生呼吸窘迫及发绀的原因，大概与以下几个因素有关：呼吸肌及腹壁肌痉挛、喉肌痉挛、胃内容物反流阻塞呼吸道、喉头分泌物过多、严重抽搐引起脑缺氧、过量的镇静药抑制呼吸中枢和肺部感染等。呼吸窘迫与抽搐互为因果，在严重病例，二者成为恶性循环，故有此症状者多属严重病例。
5.发热的高低 有高热者，除合并感染外，还与严重抽搐或反复窒息有关。故有高热者，亦属严重病例。
6.有无并发症 严重病例多有并发症存在。特别是肺部感染，是造成死亡的主要原因，应积极抢救。
虽然新生儿破伤风病死率很高，但掌握治疗原则，采用综合疗法，如能度过危险期(起病后10天左右)，则大多数病例可以治愈。由于本病的自限性，破伤风毒素与神经细胞的结合是暂时的，可以恢复的，因此可望痊愈而不致产生后遗症。完全恢复需2～3个月。
