1)沙门氏菌属：是细菌性食物中毒最常见的病原菌之一。革兰氏染色阴性，其中以鼠伤寒、猪霍乱、肠类沙门氏菌较常见。沙门氏菌主要存在于家畜、家禽及鼠类体内。该菌对外界抵抗力较强，在水、乳类及肉类食品中，能生存几个月。
(2)嗜盐菌(副溶血性弧菌)：是多形态杆菌，革兰氏染色阴性，在含盐的培养基上，生长繁殖良好，故本菌广泛存在于海产品及物盐腌制的肉类、蛋类和感菜中。中毒后主要病变在胃粘膜、空肠及回肠，表现为急性胃肠炎。
(3)变形杆菌，为革兰氏染色阴性杆菌，广泛存在于正常人的肠道、粪便及食品中。本菌在食物中能产生肠毒素，其些变形杆菌能使蛋白质中的组胺酸脱羧而成为组胺，从而引起胃肠道过敏反应。
(4)大肠杆菌及副大肠杆菌：革兰氏染色阴性杆菌，在正常人肠道内均有存在。一般情况下不致病，但在进食本类细菌污染的食物，而细菌及其毒素甚多时，可以致病。
(5)金黄色葡萄球菌(简称金葡菌)：革兰氏染色阳性球菌，常存在于正常人的皮肤、鼻腔、咽喉部和皮肤病人的感染化脓病灶中，此菌主要污染淀粉类食物、乳制品、蛋类和肉类。食物中毒主要由血浆凝固酶阳性的金葡菌所产生肠毒素引起。该毒素对热的低抗力极强，加热者沸30分钟仍保持其毒性。
