蝇蛆病的主要症状表现在蝇蛆对宿主或患者的机械刺激。蝇蛆身体表面的毛，钩，刺，移行等会刺激宿主的体壁。患者会感到身体里某部位有刺，痛，痒，异物感，移行感等。比如鼻蛆病患者会打喷嚏，鼻内异物感。泌尿生殖道蝇蛆病患者会感到下腹，尿道，阴道内有刺痛感，移行感，尿频，尿急，尿痛等。皮蛆病患者会感到皮下锥痛，皮下有移行感，皮下甚至可见蝇蛆移行后留下的隧道。另外蝇蛆体表带有细菌，可能引起感染。引起鼻蛆病的蝇蛆可能会通过鼻窦进入颅腔，造成严重后果，甚至引起死亡。引起眼蝇蛆病的蝇蛆可能会进入眼球内部，破坏眼内组织，造成失明。一些蝇蛆会以宿主身体组织为食，如螺旋锥蝇的蝇蛆。造成的后果严重，甚至是死亡。
(1)匐行疹 当蝇蛆穿过皮肤,在皮下组织移行时,皮肤上出现红色的水肿性隆起,幼虫即隐藏在水疱前端的正常皮肤内。
(2)疖肿型 初发时在皮肤上出现大小不等,深浅不一的结节或肿块,伴有疼痛和压痛,蝇蛆就生存地结节内,当幼虫快要钻出皮肤时,肿块逐渐增大,局部水肿加剧,皮面毛孔扩张,有锥刺样的疼痛及虫体蠕动感,几小时后肿块或结节表面出现黄豆大水疱,疱壁薄而紧张,若刺破疱壁可以从黄红色粘液中挤出幼虫,随后肿块缩小,炎症也随之消退,中心留下一个穿凿性小孔而愈.若蝇蛆寄生的部位很深,结节需数月才能破溃,这种情况少见.若结节不破溃,蝇蛆可在皮下潜行数厘米后又重新出现新的结节或肿块,在肿块表面出现小丘疹,形成假性脓肿,此型称变异性皮肤蝇蛆病.疖肿型皮肤蝇蛆病多发生于皮肤松弛部位,多见于眼睑,口唇,腹,前臂深处,数目1～2个或多达10余个。
