1、治疗肛管炎可口服抗生素，治疗引起该病的腹泻等肠道感染;或使用缓泻剂，使粪便排泄正常，如麻仁润肠丸等。
2、治疗肛管炎可以使用各种痔疮栓和痔疮膏。
3、治疗肛管炎可以温盐水坐浴局部，使局部保持清洁，并可在肛窦底部涂5%~10%硝酸银溶液，每日1次。也可用橄榄油30~60mL灌肠。
4、治疗肛管炎可以选用水杨酸偶氮磺胺吡啶,发作期成人开始每日2-3克,分3-4次服,如无不良反立,则逐日增至每日4~6克,分3~4次服,症状好转后渐减至每日1~2克,分3次服,至少维持1年,89%的人可保持无症状.增大用量虽可提高疗效,但副作用也增加。
5、肛管炎的手术治疗切口应距离肛缘3-5cm，以免损伤括约肌。应置管或放置油纱布条引流。骨盆直肠间隙脓肿要在腰麻或全麻下进行，切开部位因脓肿来源不同而不同:
发生肛管炎，要及时到正规的医院进行治疗，不可疏忽大意，患者要注意饮食清淡，要养成按时排便的好习惯，要注意休息，避免过度疲劳，要配合医生的治疗。
